牢房区（2），下楼梯到地下牢房找到墙洞（3）进入警卫室（4），来到走廊看到炮塔正在攻击蚁狮，用重力枪将炮塔摔毁，这样蚁狮就可在监狱通行了。往前到楼梯间（5）回到一层，在警卫室（6）的墙上找到生命和电力恢复点，监视器可看到监狱各处的警卫情况。由楼梯间（7）到二楼，往前在通道（9）摧毁两座炮塔，进入它们保护的大门，里面是有水池的房间（10），跳入水中游到对面的平台（11），沿通道进入炸掉天花板的房间（12），沿着堆积的水泥板跳到二楼，往前来到牢房区（13），这里会遇到四只猎头蟹。前方的道路被封闭，由炸坏的地板一直跳到一层。出去来到大厅（14），在平台（15）有两座炮塔，投掷手雷将它们炸掉，由楼梯上到顶层沿着走廊穿出去。来到房间（16）拿补给，将堵住走廊的箱子打碎，跑到尽头越过栏杆跳到大厅（17），在这里遇到第二只蚁狮卫兵，边退边战，不断用重力枪吸附油桶等物朝它投掷，身上有手榴弹或榴弹的话也拿出来使用，将它炸死后牢房各处的地洞会陆续跳出蚁狮，成为后面战斗的好帮手。
进入走廊（18）展开战斗，专心用霰弹枪对付空中的飞锯，蚁狮则是护卫队员的克星。来到牢房区的走廊（19），控制室（20）有一道电磁屏障，用重力枪将墙上的插头打掉消除屏障，进屋将墙上的开关拉下来，打开走廊的铁门。上楼（21）进入警卫室（22），用墙上的开关打开另一道栅门（23），和蚁狮一起进入走廊（24），将炮塔和士兵全部清除后，用重力枪将墙边的栅门移开，打碎盖板进入通风道，由此爬入排风室（25），用重力枪拾取屋里的杂物，如铁锹、木板、水桶等卡住巨大风扇的叶片，这样就可从风扇间隙爬过去了。来到走廊（26）射杀敌人，用重力枪将两座炮塔摧毁，将墙上的插头拔下来消除电磁屏障，这时蚁狮可以会合过来了。而后上楼梯进入牢房区（27）展开战斗，开枪射杀远处平台上的机枪手，走廊地上有激光探测器，蚁狮会前赴后继引爆它们，冲到前面走廊用手榴弹炸毁两座炮塔，进入附近的走廊清除机枪手和炮塔，由楼梯一直杀到四层平台找到控制室（28），在墙上找到生命和电力的恢复点，从窗户可看到敌人的增援部队赶来，派蚁狮去应付他们。在房间墙上按动开关，原路返回找到打开的铁栅门（29），进入走廊（30）遭遇几名敌兵，派蚁狮杀掉。往前面的走廊（31）有两座炮塔，用手榴弹炸掉。进入洗衣房大厅（32），这里的战斗仍然派蚁狮当主力，用弓弩射杀较远一些的枪手。由竖梯上平台进入厨房（33），这里有三座炮塔，在这里蚁狮会破坏煤气管道引起大火，穿出厨房上楼梯进入警卫室（34）拿补给，用墙上的恢复点补满生命。由警卫室破碎的窗口跳到大厅（35），在这里再次遭遇强悍的蚁狮卫兵，将它杀死后由大厅的一侧找到杂乱的通道（36），这时前后的路会被封死，往左攀上平台找到出路，从尽头的竖井跳下去。
第十章 牵连设备
由坑道爬出去是一条铁路线，在这里看到爱莉克斯的身影一晃而过，顺着铁路线往前走找到她，得知伊莱博士可能被关在封锁区某处，跟随着她跑进建筑，上电梯（1）进入走廊（2）开始战斗。杀掉三名敌人后，爱莉克斯到房间（3）进入基地的安全系统查找伊莱的位置，然后消除走廊的电磁屏障（4），跟着她上楼梯（5），在走廊（6）杀掉五名敌人进入房间（7），爱莉克斯利用电脑找到密封舱里的伊莱博士，打算利用克莱纳的传送门救他出去，可是目前传送门还没修好。
回到走廊（6）爱莉克斯离开，接下来要单独行动，不过会收到爱莉克斯的通话提示，并用敌人的安全系统来帮助通过这片封锁区。出门下阶梯，在左侧房间（8）杀掉两只猎头蟹拿到弹药，穿出走廊爱莉克斯会用电脑打开大门（9），走廊另一端的大门（10）却打不开，这时按她的指点到警卫室（11），打碎架子在后面找到排风通道（12），钻
